ตำบลต้นยวนเป็นตำบลเก่าแก่ เมื่อ พ.ศ.2439 ขึ้นตรงต่ออำเภอคีรีรัฐนิคม หรือท่าขนอนในสมัยนั้น ได้มีขุนวิจารณ์เป็นกำนันคนแรก ต่อมาปี 2447 ได้ย้ายมาขึ้นกับกิ่งอำเภอพนม และแบ่งออกเป็นตำบลคลองชะอุ่นอีกหนึ่งตำบล ปัจจุบันมี 12 หมู่บ้าน คำว่า ต้นยวน เนื่องมาจากในพื้นที่มีต้นไม้ขนาดใหญ่ และมีผึ้งมาเกาะทำรัง ในต้นหนึ่งจะมีหลายรัง เรียกกันว่า ยวนผึ้งหรือต้นยวน